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簡昆鎰

簡昆鎰 (Kun-Yi Chien)

職稱:副教授

研究室名稱:蛋白質體分析實驗室

最高學歷:Ph.D.

學校/國家:清華大學/台灣

分機號碼:5971

電子郵件帳號: kychien@mail.cgu.edu.tw

個人網頁網址:

研究室現有: 博士後研究員 0

博士班研究生 3

碩士班研究生 1

專任研究助理 0

大學部專題生 0

 

研究方向研究室特色
蛋白質體學研究是指全面性的探討蛋白質表現程度的學門。在生物醫學領域中,通常著重於找出兩個樣品之間相對差異表現的蛋白。由於分析技術的快速進步,使得蛋白質體分析的覆蓋率,已逐漸趕上基因體學研究。其中最主要的兩項技術為質譜學及胜肽分離技術。本實驗室主要的研究興趣就是針對這兩項技術進行研發及改進,以提升蛋白質體數據的廣泛度、靈敏度、可信度及自動化程度。
對於胜肽分離系統的改進,我們建立了多種奈米級多維液相分離系統,不論是一般性的整體蛋白體分析,或是特定族群胜肽的純化分離,且其效能均已達國際一流的水準。利用這些系統,我們可以從50ug的細胞蛋白萃取物中鑑定出3000-5000個蛋白,甚至可從40ug蛋白中鑑定出2000段以上的磷酸化胜肽。至於在質譜測量方面,我們著重於開發嶄新的同位素標定技術,以提高質譜定量數據的可靠性。目前我們以建立兩種標定技術,其中之ㄧ可進行整體蛋白體定量分析,另一則專注的定量特定胺基酸的氧化程度。這些技術都將運用於疾病蛋白體學研究,尤其將著重於分析臨床的組織或體液樣品。

目前進行中研究:

  1. 建立高敏感度之磷酸化胜肽純化分離系統:組合陰離子交換、氧化金屬及逆相層析等三種液相層析法的線上三維磷酸化胜肽純化分離系統,可有效提高偵測靈敏度。未來將運用於口腔癌組織磷酸化蛋白體分析。
  2. 以穩定同位素標籤質譜學進行蛋白之甲硫胺酸氧化狀態之定量:利用可區分氧化態及還原態甲硫胺酸之同位素試劑,可以準確定量蛋白之甲硫胺酸氧化狀態。未來將運用於研究氧化壓力對細胞及生物個體之影響及與疾病之關聯。
  3. 開發嶄新的同位素標的技術運用於質譜定量蛋白質體學:利用氧-18(18O)標定於酸性胺基酸,可用於製備定量用蛋白標準品,準確定量樣品中特定蛋白含量。未來將運用於臨床的體液及組織樣品找尋並驗證特定疾病的標幟分子。

 

最近五年所發表論文:

  1. Chen, T.-S., Chung, F.-Y., Tjong, S.-C., Goh, K.-S., Huang, W.-N., Chien, K. -Y., Wu, P.-L., Lin, H.-C., Chen, C.-J. and Wu, W.-G. Structural difference between group I and group II cobra cardiotoxins: X-ray, NMR, and CD analysis of the effect of cis-proline conformation on three-fingered toxins. Biochemistry 2005, 44(20):7414-7426.
  2. Wu, C.-C., Chien, K. -Y., Tsang, N.-M., Chang K,-P., Hao, S.-P., Tsao, C.-H., Chang, Y.-S. and Yu, J.-S. Cancer cell-secreted proteomes as a basis for searching potential tumor markers - nasopharyngeal carcinoma as a model. Proteomics 2005, 5(12):3173-3182.
  3. Cheng, A.-J., Chen, L.-C., Chien, K.-Y., Chen, Y.-J., Chang, J.-T., Wang, H.-M., Liao, C.-T. and Chen, I.-H. Oral Cancer Plasma Tumor Marker Identified with Bead-Based Affinity Fractionated Proteomic Technology. Clin. Chem. 2005, 51(12):2236-2244.
  4. Hwang, T. -L., Liang, -Y., Chien, K. -Y. and Yu, J. -S. Overexpression and elevated serum levels of phosphoglycerate kinase 1 in pancreatic ductal adenocarcinoma. Proteomics 2006, 6(7):2259-2272.
  5. Chien, K. –Y., Chang, Y. -S, Yu, J. -S, Fan, L. -W., Lee, C. -W. and Chi, L. -M. Identification of a new in vivo phosphorylation site in the cytoplasmic carboxyl terminus of EBV-LMP1 by tandem mass spectrometry. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006, 348(1):47-55.
  6. Chen, C. -T., Chen, W. -Y., Tsai, P. -J., Chien, K. –Y., Yu, J. -S. and Chen, Y. -C.* Rapid enrichment of phosphopeptides and phosphoproteins from complex samples using magnetic particles coated with alumina as the concentrating probes for MALDI MS analysis. J. Proteome Res. 2007, 6(1):316-325.
  7. Chen, C. -D., Wang, C. -S., Huang, Y. -H., Chien, K. -Y., Liang, Y., Chen, W. -J. and Lin, K. -H.* Overexpression of CLIC1 in human gastric carcinoma and its clinicopathological significance. Proteomics 2007, 7(1):155-167.
  8. Lin, J. -Y., Li, M. -L., Huang, P. -N., Chien, K. –Y., Horng, J. -T. and Shih, S. -R.* Heterogeneous nuclear ribonuclear protein K interacts with the enterovirus 71 5' untranslated region and participates in virus replication. J. Gen. Virol. 2008, 89(10):2540-2549.
  9. Huang, K. -Y., Chien, K. –Y., Lin, Y. -C., Hsu, W. -M., Fong, I. -K., Huang, P. -J., Yueh, Y. -M., Gan, R. -R. and Tang, P.* A proteome reference map of Trichomonas vaginalis. Parasitol Res. 2009, 104(4):927-933.
  10. Chi, L. -M., Lee, C. -W., Chang, K. -P., Hao, S. -P., Lee, H. -M., Liang, Y., Hsueh, C., Yu, C. -J., Lee, I. -N., Chang, Y. -J., Lee, S. -Y., Yeh, Y. -M., Chang, Y. -S., Chien, K. -Y.* and Yu, J. -S.* Enhanced interferon signaling pathway in oral cancer revealed by quantitative proteome analysis of microdissected specimens using 16O/18O labeling and integrated 2DLC-ESI-MALDI tandem MS. Mol. Cell. Proteomics 2009, 8(7):1453-1474.
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